在埃及與宿敵DIO的死鬥之後過了11年。1999年，空條承太郎為了與祖父喬瑟夫·喬斯達的私生子東方仗助見面，而來到了日本M縣S市杜王町。但，仗助卻持有與承太郎相同的特殊能力“替身”。之後，以承太郎的來訪為開端，仿佛被吸引壹般，新的“替身使”們開始行動。“這座城鎮存在著什麽……”為了守護養育了自己的杜王町，仗助挺身而出——。