三千万年前人类已经存在，并拥有高度科技，称为超古代。而迪迦奥特曼是在超古代造访地球的光之巨人。在经过了人类的光暗战争之后，超古代人类自己选择了灭亡的道路，迪迦奥特曼等光之巨人尊重人类的选择身体变成了石像形态封于金字塔内，而灵魂则化成光离开地球。21世纪初期，地球不再有侵略和战争，人类迎来了新的时代。然而预言中的“大地的怪兽”哥尔赞及“天空的怪兽”美尔巴出现了，可以消灭这两只怪兽的只有迪迦奥特曼。