《与君初相识·恰似故人归》分为上下两部。上部《与君初相识》，下部《恰似故人归》。故事讲述了御灵师纪云禾自幼被谷主以毒药所控，梦想不惜一切代价出逃，寻找自由，为此她决定利用被送入谷中的鲛人长意。但长意的天真纯善逐渐温暖了云禾的心，两人终从天敌发展为恋人。然而命运使然，两人虽深爱彼此，却不得不相互伤害，天各一方。所幸两人虽历经磨难，都获得了成长，在一众好友的相助下终于重逢。此时仙师与顺德仙姬为了一己私欲，意图毁灭世间，长意与云禾选择共同肩负起责任，还世间和平后，终得相守。